公司要证明员工违反了竞业限制协议，可以从多个方面入手收集和提供证据。

首先，公司可以通过各方渠道了解员工的合同签订和社保缴纳情况，以确定员工是否在协议约定的期限内与其他竞争公司签订了劳动合同或开始缴纳社保。

其次，公司可以安排专人在竞争对手公司外部进行蹲守，搜集员工每日上下班的视频证据，以证明员工确实在竞争对手公司工作。

此外，公司还可以向员工寄送快递，以快递签收或快递录音作为证据，证明员工已经收到了公司的相关通知或警告。

另一种方法是通过猎头公司猎聘该员工，让员工本人主动“交代”目前的就业情况。这种方法可能需要一些技巧和策略，但如果操作得当，可能能够获取到直接的证据。

最后，公司还可以向竞争对手公司主动发函，强调侵犯商业秘密的连带责任问题，以此作为间接证据来支持其主张。

除了以上具体的取证方法，公司还需要确保竞业限制协议本身具有合法性和有效性。协议应明确约定竞业限制的范围、地域、期限等关键内容，并且符合相关法律法规的规定。此外，公司还需要在员工入职时明确告知其竞业限制义务，并在员工离职时进行必要的提醒和确认。

在收集到足够的证据后，公司可以通过法律途径来维护自己的权益。这可能包括向法院提起诉讼或向劳动仲裁机构申请仲裁等。然而，需要注意的是，每个具体案件的情况都会有所不同，因此在实际操作中应根据具体情况灵活调整取证和维权策略。

请注意，以上只是一些常见的取证方法，并不能保证在所有情况下都能成功证明员工违反了竞业限制协议。因此，在实际操作中，公司可能需要结合多种方法和策略，并寻求专业法律人士的帮助，以确保能够有效地维护自己的权益。